館藏檢索系統兼具目錄查詢及數位影像閱覽功能；除了基本與進階檢索功能外，並以分割視窗顯示檔案之階層關係與描述資訊。已提供數位影像者，可直接於線上申請閱覽；未提供數位影像者，可於線上申調後至檔案館閱覽室閱覽。 館藏內容分為外交、經濟兩大部分。其中外交檔案含括 1860 至 1928 年的總理各國事務衙門、外務部與北洋政府外交部檔案，計有目錄 277,972 筆，影像 1,166,131 頁；經濟檔案計有目錄 113,711 筆，其中提供影像的全宗為：05 商部、06 農工商部、07 工商部、08 農商部、09 全國水利局、10 內務部、17 實業部、18 經濟部商業司、23 建設委員會、26 全國經濟委員會、28 汪政府經濟部門、30 行政院經濟安定委員會、31 行政院美援運用委員會、36 行政院國際經濟合作發展委員會、49 臺灣區生產事業管理委員會、50 行政院外匯貿易審議委員會，共 3,404,585 頁。